讲到肠内细菌，我们常常听到「好菌有益人体」、「坏菌有害健康」的说法，其实这样简单的二分法并不正确。我们了解到医护专业人员为了方便卫教，在时间与资源有限的情形下必须将肠道细菌一刀切，但事实上，所谓的「坏菌」横行固然不利健康，但肠道里如果都是所谓的「好菌」，对身体也没有好处。
好菌
一般常提到的各种益生菌，以乳酸菌与部份酵母菌种为主，可以促进肠道菌种平衡，增进人体健康。常见的好菌包括：
1.嗜乳酸杆菌：又称Ａ菌，主要分布在小肠，族群数量最大，具有强化免疫力、降低胆固醇及调节肠道细菌平衡作用。
2.比菲德氏菌：又称Ｂ菌，或是双歧杆菌，能够制造酸性环境，减少坏菌繁殖，抵抗病原菌的感染，同时还能抑制肠内腐败物质产生，及合成维生素Ｂ群。
3.干酪乳酸杆菌：又称Ｃ菌，或是凯氏乳酸菌，可以有效抵挡胃酸，顺利到达肠道。预防肠道不适，提升免疫力，促进嗜酸乳杆菌成长，抑制过敏性物质释放。
4.副干酪乳酸杆菌：又称ＬＰ菌，能耐胃酸，顺利到达肠道，可以抗过敏，减低发炎反应。
坏菌
例如魏氏杆菌、大肠杆菌等。当这些菌种占优势时，会让消化不完全的蛋白质腐败，产生有害毒素。然而，他们并非一无是处，大肠杆菌可以生成维生素Ｋ，分解非水溶性膳食纤维，并能击退外来的病原菌、那些「好菌」无法应付的对手。
日本理化学研究所的一项实验则显示了「好菌」、「坏菌」更深一层的关系。他们发现，比菲德氏菌吸收果糖产生醋酸，保护肠道免于大肠杆菌O157分泌的毒素侵害，但是给予更多比菲德氏菌并无法杀死O157或减少毒素，反倒是O157会吸收比菲德氏菌生成的胺基酸，当做自己的能源。这代表两者其实是共生关系。
养好菌就能维持肠道菌丛平衡健康！下面告诉您3种养菌好食物
强免疫不生病，关键在「平衡」！3食物养出一肠好菌
增加益生菌的饮食
不用费心想着如何消灭坏菌，只要增强「好菌」、也就是益生菌在肠道的优势地位，就能保持肠道细菌的平衡，维持身体健康。要达到上述目标，一方面要适时补充益生菌的数量，另一方面则要多提供益生菌喜欢的食物，双管齐下便能做到。
简单地说，发酵食物因为透过乳酸菌或酵母菌等进行发酵过程，因此在食物中也会含有有益肠道的菌种。日本医学博士藤田纮一郎就很推崇日本传统发酵食物如味噌、纳豆：
味噌
由黄豆发酵而成，会产生许多维生素B群，原本不易分解的蛋白质也因水解过程，变得容易被肠胃吸收。
纳豆
含有大量令骨骼强健的维生素K与B2，钙、磷、钠、钾、铁等矿物质也很丰富，可预防老化及高血压、心脏病。
酱油
用黄豆等原料经过一年以上的熟成过程，也是发酵食物的一种。不过现在市面上有很多不是传统酿造法制作的速成酱油，并不算是发酵食物。
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